This is a demo instance. You can upload any data you like, including test data to try things out. You can find test data to upload in the example data repository. This instance should not be used for analysis.

PPD_00JT7GQ.1

Germany/PPD_00JT7GQ.1/2026-06
A. Brinkmann, C. Kohl, L. Schrick, J. Michel & A. Nitsche

Robert Koch Institute, ZBS1

Sample details

Collection date
2026-06
Sampling location
Germany
Isolate name
MPXV/Germany/2026/ON/RKI1669

Data use terms

Data use terms
OPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
C.1.2

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2026-07-06
NCBI update date
2026-07-06

Host

Host

Submission details

Submission ID
PZ585031.1
Submitting group
Date submitted
2026-07-07 04:35:42 UTC
Date released
2026-07-07 04:36:08 UTC
Earliest release date
2026-07-06

Alignment and QC

Length
190556 (96.2%)
# of SNPs
92
# of inserted bases
22
# of deleted bases
153
# of unknown bases
1069

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions
  • G1262A
  • C1365T
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C3987T
  • C7771T
  • G14000T
  • G15428A
  • G16720A
  • G17112A
  • A18769G
  • G21723A
  • C23564T
  • G25661A
  • G28142A
  • T28175C
Deletions
608, 609, 133177-133186, 136549-136554, 146865-146881, 150586-150602, 179162-179262
Insertions
ins_173309:NNNNATATATATATATATATAT

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:E71K
  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG016

  • OPG016:R84K

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG029

  • OPG029:A117V

OPG044

  • OPG044:D18N

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG074

  • OPG074:R665C

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:D249N
  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG117

  • OPG117:H201Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG123

  • OPG123:D616N

OPG124

  • OPG124:L16F

OPG129

  • OPG129:D399N

OPG132

  • OPG132:D277N

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG148

  • OPG148:R259K

OPG149

  • OPG149:D61N

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG176

  • OPG176:S20F
  • OPG176:H221Y

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG195

  • OPG195:E27K

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions

OPG153

OPG153:384, OPG153:385
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue